發動機水箱生銹、結垢是最常見的問題。銹跡和水垢會限制防凍液在冷卻系統中的流動，降低散熱作用，導致發動機過熱，甚至造成發動機損壞。防凍液氧化還會形成酸性物質，腐蝕水箱的金屬部件，造成水箱破損、滲漏。解決水箱故障的辦法主要在平日的例行檢查，應該經常察看水箱是否有漏水或銹蝕現象，要按時清洗，更換或添加防凍液，以提高沸點，延長使用壽命。一般來說，行駛兩萬公里或一年時間就應更換防凍液。這樣可以起到提高沸點，防止產生水垢、銹蝕及提升散熱效果，使水泵產生潤滑作用，避免與消除氣泡引起瞬間高溫所造成的發動機傷害。
當防凍液缺少時也盡量不要加水來添補，尤其是在夏天。因為自來水中含有的氯氣成分會對水箱、發動機等系統產生腐蝕、銹蝕、阻塞，使冷卻系統冷卻不暢，造成發動機溫度過高致使車輛損傷。
