冷卻系經過長時間的使用，加用生水或質量不高的防凍液，會在冷卻系（散熱器、缸體的水套）中產生大量的水垢、鐵銹和泥沙，使冷卻效率降低。因此，使用普通水的冷卻系，每六個月應清洗一次。其他使用防凍液的冷卻系的發動機，應在更換防凍液或大修發動機時，徹底清洗一次冷卻系。
1.檢查冷卻液
在清洗冷卻系時，如果發動機是熱的狀態，不要直接打開散熱器蓋，以防熱水噴出燙傷。須等待發動機冷卻后，再用抹布裹著打開散熱器蓋，如果散熱器內還有殘余壓力，打開時會聽到排氣的聲音，應注意防護。
如果冷卻液不足，應補充開水到溢出為止。盡量避免加生水（添加生水會產生水垢）。如果冷卻液變得污濁或充滿水垢，應將冷卻液全部放掉，并清洗冷卻系。
2.清洗冷卻系
（1）簡單清洗。洗滌時，應放凈舊冷卻液，將發動機冷卻系加滿清潔水（自來水），起動發動機運轉5min后放出。放出的水若比較污濁，應重復上述步驟直至水清為止。
（2）徹底清洗。當發動機散熱性能不好、發動機冷卻系水垢過多時，可使用專用的散熱器清洗劑進行清洗。冷卻系洗滌步驟如下：
起動發動機，使其溫度達到正常的工作溫度后，停止發動機轉動并放凈冷卻液，將混有清洗劑的清洗液加入到冷卻系中。起動發動機，使發動機溫度達到正常工作溫度并怠速運轉2O-30min，然后使發動機停止轉動，放出清洗液。
用清潔的水沖洗冷卻系5min后將發動機內注滿清潔的水，再起動發動機使其運轉10min后放出即可。如果排出的液體較臟，應繼續用清水反復清洗直到放出清水為止。
清洗冷卻系時，如果發動機溫度低于正常溫度（85℃），則節溫器閥不能打開，清洗液只做小循環，并不在散熱器和缸體水套中循環。所以，必須保持在正常溫度。
在清洗冷卻系后，應再次檢查散熱器冷卻液情況。如果發現散熱器口有氣泡出現，說明冷卻系內混有空氣。常見的原因是氣缸內的氣體進入冷卻系，應到維修廠排除故障。
（3）冷卻液使用注意事項。
冷卻液及其添加劑均為有毒物質，切勿接觸，并置于安全場所；冷卻液的使用濃度（體積分數）為40%-60%；放出的冷卻液不宜再使用，應嚴格按有關法規處理廢棄的冷卻液；凡更換缸蓋、缸墊、散熱器時，必須更換冷卻液；發動機熱態時，冷卻系內仍處于高溫高壓狀態。因此，此時切勿打開散熱器蓋以防燙傷；發現冷卻液大量損耗，則必須待發動機處于冷態時，方可添加冷卻液，以免損壞發動機；緊急情況下，若全部加入純水，在低溫地區則須盡快按規定添加冷卻液添加劑，使冷卻液濃度恢復正常狀態以防止結冰造成零件損壞；冬季來臨前應檢查一下冷卻液濃度，并按規定調配濃度，保證冷卻液具有足夠的防凍能力。
